In seguito alla verticalizzazione degli istituti scolastici del 1996 (unità scolastiche che aggregano scuole materne, elementari e medie), sono stati creati a San Giuliano tre Istituti comprensivi, ognuno dei quali coordinato da un dirigente scolastico, che raggruppano le varie scuole del territorio, dalla scuola dell'infanzia alla secondaria di 1° grado.
I tre Istituti di San Giuliano Milanese, con relativo Dirigente e scuole di appartenenza, sono:
ISTITUTO COMPRENSIVO "E.FERMI"
via Giovanni XXIII 18, Tel. 02 9846156 - Fax 02 9846056
Dott.ssa Anna Teresa Ferri
ISTITUTO COMPRENSIVO "MONTESSORI"
Certiquality - sistema di gestione qualità certificato UNI EN ISO 9001:2000
p.zza Italia, Tel. 02 9846485 - Fax 02 98243285
Dott.ssa Fiorella Avallone
DIREZIONE DIDATTICA STATALE CAVALCANTI "1° CIRCOLO"
via Cavalcanti, Tel. 02 9848341 - Fax 02 98241915
Dott.ssa Tiziana Germani
Anche l'attività dei cinque asili nido comunali è coordinata da un referente unico, la sig.ra Sipontina Prencipe Tel. 02 9848688